Audio Ninja это музыкальное приключение, в котором игрок управляет молодым ниндзя, получившим секретное оружие для победы над врагами с помощью ритма. Противники в Audio Ninja окрашены в светлые или темные тона, и, соответственно, у игрока есть два типа атак. Во время путешествия можно использовать специальные наушники - они позволят замедлить, ускорить и даже вернуться назад во времени. Существуют и другие предметы облегчающие геймплей.

В Audio Ninja имеется 3 мира, 48 уровней, 9 супер уровней и режим выживания с 3-мя темами.